هناك قدرا كبيرا من مؤسسات التعليم العالي في جميع أنحاء قيرغيزستان. وهذا يشمل جميع أنحاء سبعة وثلاثين الجامعات الحكومية وثمانية عشر جامعات خاصة. وتشمل أبرز الجامعات في قيرغيزستان جامعة آسيا الوسطى وجامعة قيرغيزستان الوطني.