سكان جنوب السودان لديها خيار لمواصلة التعليم العالي في أي جامعة أو مدرسة مهنية. على الرغم من وجود نقص في كلتا المؤسستين، العديد من البرامج المعمول بها لتوسيع المشهد الحالي للتعليم العالي في جنوب السودان.

درجة الماجستير في إدارة الأعمال عبارة عن درجة مهنية تُمنح لأولئك الذين يدرسون إدارة الأعمال في كلية إدارة الأعمال. تتم دراسة مختلف أشكال التحليل والاستراتيجية بما في ذلك العمليات، والتسويق، والمالية، والمحاسبة.